Dizajn linije za preradu žitarica uključuje određivanje cjelokupnog rasporeda na temelju vrste sirovina, ciljeva prerade i zahtjeva proizvodnog kapaciteta. Općenito, dizajn bi trebao obuhvatiti ključne faze kao što su čišćenje, drobljenje, prosijavanje, sušenje, usitnjavanje, miješanje i pakiranje. Odabir opreme za svaku fazu mora uzeti u obzir kapacitet prerade, prilagodljivost i razinu automatizacije, dok se istovremeno osigurava da zrno ostane bez kontaminacije i oštećenja tijekom cijelog ciklusa prerade. Dizajn bi trebao sadržavati racionalan raspored transportnih sustava materijala-kao što su trakasti transporteri, pužni transporteri ili pneumatski transport-kako bi se osigurao besprijekoran protok materijala i smanjila stagnacija ili gubitak tijekom međufaza. Dijagrami toka procesa i planovi rasporeda opreme trebali bi jasno ocrtati lokaciju svake faze, usmjeravanje cjevovoda i potrebne operativne razmake kako bi se olakšale naknadne aktivnosti izgradnje i održavanja.
Nadalje, dizajn linije za preradu žitarica mora dati prednost sigurnosti, higijeni i energetski-učinkovitim, ekološki prihvatljivim postupcima. Raspored opreme trebao bi osigurati dovoljno prostora za rad i održavanje kako bi se spriječila prenatrpanost, koja bi mogla ugroziti sigurnost osoblja i učinkovitost održavanja. Odabir materijala za komponente opreme mora biti u skladu sa-sigurnosnim standardima za kontakt s hranom, sa svojstvima otpornosti-na koroziju i lakoćom čišćenja. Sustavi za usisavanje prašine, ventilacijski uređaji i mehanizmi za zbrinjavanje otpada trebaju biti dizajnirani istovremeno kako bi se ublažilo raspršivanje prašine i onečišćenje okoliša. Električni upravljački sustav može koristiti ili potpuno automatizirane ili polu-automatizirane kontrole za povećanje učinkovitosti i stabilnosti proizvodnje, dok također olakšava dijagnosticiranje kvarova. Sveobuhvatni dizajn trebao bi integrirati raspoloživi pogonski prostor, infrastrukturu opskrbe energijom i buduće zahtjeve za proširenjem kako bi se stvorilo rješenje za preradu žitarica koje je i visoko učinkovito i sigurno, čime se uspostavlja pouzdan temelj za kasniju proizvodnju i operativno upravljanje.
